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Enregistrement W2024912040 · doi:10.1021/jp8014047

Color-Tuning Mechanism in Firefly Luminescence: Theoretical Studies on Fluorescence of Oxyluciferin in Aqueous Solution Using Time Dependent Density Functional Theory

2008· article· en· W2024912040 sur OpenAlexaff
Zhongwei Li, Ai‐Min Ren, Jing‐Fu Guo, Tianxiao Yang, John D. Goddard, Ji‐Kang Feng

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTime-dependent density functional theoryDensity functional theoryChemistryAqueous solutionFluorescenceCounterionTautomerPhotochemistryExcited stateLuminescenceFirefly protocolSinglet stateComputational chemistryIonPhysical chemistryStereochemistryAtomic physicsOpticsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The first singlet excited state geometries of various isomers and tautomers of firefly oxyluciferin (OxyLH2), as well as their fluorescence spectra in aqueous solution, were studied using time dependent density functional theory (TDDFT). With changing pH in aqueous solution, three fluorescence peaks, blue (450 nm), yellow-green(560 nm), and red (620 nm) correspond to neutral keto and enolic forms, the monoanionic enolic form,and the monocationic keto form respectively. A counterion, Na+, was predicted to cause a blue shift in the fluorescence of anionic OxyLH2. The contributions of a charge transfer (CT) state upon electronic excitation of the planar and twisted structures were predicted. CT was large for the twisted structures but small for the planar ones. The differences between pK and pK* of various oxyluciferin species were predicted using a Forster cycle. A new possible light emitter, namely, the monocation keto form (keto+1), was considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,548

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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