DNA Double Strand Break Repair in Mitosis Is Suppressed by Phosphorylation of XRCC4
Notice bibliographique
Résumé
Cells are continuously subjected to DNA damage, the most cytotoxic form of which is the DNA double-strand break (DSB).DSBs arise from endogenous sources, such as collapsed replication forks, or can be caused by exogenous agents that include ionizing radiation, reactive oxygen species, and chemotherapeutic drugs such as topoisomerase II poisons [1].During interphase, DSBs are repaired by one of two main pathways: classical non-homologous end joining (C-NHEJ) or homologous recombination repair (HRR) [2].The fate of DSBs that arise during mitosis, however, has been poorly characterized.In this issue of PLOS Genetics, Shinohara and colleagues demonstrate that DSB induction in mitosis leads to the formation of anaphase bridges, a hallmark of genomic instability, and demonstrate that their formation requires primarily the C-NHEJ pathway [3].C-NHEJ, which is active throughout interphase, is considered a rapid but errorprone pathway that rejoins DSB ends with minimal end processing.The main steps in C-NHEJ are detection of the DSB by the Ku heterodimer, followed by recruitment of end-processing factors and the DNA ligase IV-XRCC4-XLF complex.Regulation of C-NHEJ end processing is controlled by the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (DNA-PKcs) [4,5].HRR, on the other hand, occurs only in S and G2 and is initiated by the binding of the MRN complex (composed of Mre11, Rad50, and Nbs1), which is followed by MRN-and CtIP-mediated resection to create long 39 overhanging ends required for Rad51-dependent strand invasion.Unlike C-NHEJ, HRR requires an undamaged DNA template for repair, usually the sister chromatid, and results in slower, but more precise, repair [6].In addition to the two main repair pathways, DSBs can also be repaired by an error-prone, alternative end-joining pathway (Alt-NHEJ).Alt-NHEJ requires end-resection and involves CtIP, XRCC1, and DNA ligase III, but not the C-NHEJ factors [7].DSBs initiate an elaborate signaling cascade that involves protein phosphorylation
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».