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Enregistrement W2025006941 · doi:10.1021/bi011153h

Mechanistic Studies of Cyclohexanone Monooxygenase:  Chemical Properties of Intermediates Involved in Catalysis

2001· article· en· W2025006941 sur OpenAlexaboutno aff
Dawei Sheng, David P. Ballou, Vincent Massey

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésFlavin groupChemistryCyclohexanonePeroxidePhotochemistryProtonationReaction intermediateMonooxygenaseDeprotonationCatalysisStereochemistryMedicinal chemistryOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cyclohexanone monooxygenase (CHMO), a bacterial flavoenzyme, carries out an oxygen insertion reaction on cyclohexanone to form a seven-membered cyclic product, epsilon-caprolactone. The reaction catalyzed involves the four-electron reduction of O2 at the expense of a two-electron oxidation of NADPH and a two-electron oxidation of cyclohexanone to form epsilon-caprolactone. Previous studies suggested the participation of either a flavin C4a-hydroperoxide or a flavin C4a-peroxide intermediate during the enzymatic catalysis [Ryerson, C. C., Ballou, D. P., and Walsh, C. (1982) Biochemistry 21, 2644-2655]. However, there was no kinetic or spectral evidence to distinguish between these two possibilities. In the present work we used double-mixing stopped-flow techniques to show that the C4a-flavin-oxygen adduct, which is formed rapidly from the reaction of oxygen with reduced enzyme in the presence of NADP, can exist in two states. When the reaction is carried out at pH 7.2, the first intermediate is a flavin C4a-peroxide with maximum absorbance at 366 nm; this intermediate becomes protonated at about 3 s(-1) to form what is believed to be the flavin C4a-hydroperoxide with maximum absorbance at 383 nm. These two intermediates can be interconverted by altering the pH, with a pK(a) of 8.4. Thus, at pH 9.0 the flavin C4a-peroxide persists mainly in the deprotonated form. Further kinetic studies also demonstrated that only the flavin C4a-peroxide intermediate could oxygenate the substrate, cyclohexanone. The requirement in catalysis of the deprotonated flavin C4a-peroxide, a nucleophile, is consistent with a Baeyer-Villiger rearrangement mechanism for the enzymatic oxygenation of cyclohexanone. In the course of these studies, the Kd for cyclohexanone to the C4a-peroxyflavin form of CHMO was determined to be approximately 1 microM. The rate-determining step in catalysis was shown to be the release of NADP from the oxidized enzyme.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations272
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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