Conserved Residues in the Putative Catalytic Triad of Human Bile Acid Coenzyme A:Amino Acid N-Acyltransferase
Notice bibliographique
Résumé
Human bile acid-CoA:amino acid N-acyltransferase (hBAT), an enzyme catalyzing the conjugation of bile acids with the amino acids glycine or taurine has significant sequence homology with dienelactone hydrolases and other alpha/beta hydrolases. These enzymes have a conserved catalytic triad that maps onto the mammalian BATs at residues Cys-235, Asp-328, and His-362 of the human sequence, albeit that the hydrolases contain a serine instead of a cysteine. In the present study, the function of the putative catalytic triad of hBAT was examined by chemical modification with the cysteine alkylating reagent N-ethylmaleimide (NEM) and by site-directed mutagenesis of the triad residues followed by enzymology studies of mutant and wild-type hBATs. Treatment with NEM caused inactivation of wild-type hBAT. However, preincubation of wild-type hBAT with the substrate cholyl-CoA before NEM treatment prevented loss of N-acyltransferase activity. Substitution of His-362 or Asp-328 with alanine results in inactivation of hBAT. Although substitution of Cys-235 with serine generated an hBAT mutant with lower N-acyltransferase activity, it substantially increased the bile acid-CoA thioesterase activity compared with wild type. In summary, data from this study support the existence of an essential catalytic triad within hBAT consisting of Cys-235, His-362, and Asp-328 with Cys-235 serving as the probable nucleophile and thus the site of covalent attachment of the bile acid molecule.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».