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Enregistrement W2025099925 · doi:10.1152/physiolgenomics.00118.2007

Hepatic transcriptome response to glucocorticoid receptor activation in rainbow trout

2007· article· en· W2025099925 sur OpenAlexaff
Neelakanteswar Aluru, Mathilakath M. Vijayan

Notice bibliographique

RevuePhysiological Genomics · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAquaculture Nutrition and Growth
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGlucocorticoid receptorGlucocorticoidMifepristoneTranscriptomeEndocrinologyInternal medicineAntiglucocorticoidMicroarrayTroutSignal transductionStimulationGene expressionReceptorGeneCell biologyGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cortisol, the principal corticosteroid in teleosts, is thought to play a key role in the metabolic adjustments critical for regaining homeostasis. However, the target tissue molecular mechanisms involved in this adaptive response to corticosteroid stimulation are still unclear. Cortisol signaling is mediated predominantly by the glucocorticoid receptor (GR), and previous studies have shown that RU486 (a GR antagonist) offsets corticosteroid signaling in teleosts. To elucidate the molecular basis of GR-mediated metabolic readjustments, we exposed primary culture of trout hepatocytes in vitro to cortisol (to mimic stressed levels seen in fish), RU486, or a combination of both for 24 h. The gene expression was analyzed using a low-density custom-made rainbow trout cDNA array enriched with endocrine-, metabolic-, and stress-related genes. The microarray results for select genes were further validated using quantitative real-time PCR. Cortisol treatment significantly increased glucose production in hepatocytes, and this response was blocked by RU486, confirming GR-mediated corticosteroid signaling. Cortisol also elevated GR transcript levels, and this response was abolished by RU486, whereas both cortisol and RU486, either alone or in combination, reduced GR protein content in trout hepatocytes. Cortisol treatment significantly modulated the expression of several genes known to be involved in intermediary metabolism, cellular stress response, reproduction, and xenobiotic metabolism. Most of these cortisol-mediated transcript changes were abolished in the presence of RU486, suggesting a key role for GR-specific signaling in this adaptive response. Taken together, our results suggest a key role for genomic cortisol signaling in the liver molecular reprogramming that is critical for coping with stress in fish.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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