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Enregistrement W2025240437 · doi:10.1021/bc200436x

Fibronectin Binding to the <i>Treponema pallidum</i> Adhesin Protein Fragment rTp0483 on Functionalized Self-Assembled Monolayers

2011· article· en· W2025240437 sur OpenAlexaff
Matthew T. Dickerson, Morgan B. Abney, Caroline E. Cameron, Marc R. Knecht, Leonidas G. Bachas, Kimberly W. Anderson

Notice bibliographique

RevueBioconjugate Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMonoclonal and Polyclonal Antibodies Research
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesDivision of Graduate EducationNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésChemistryQuartz crystal microbalanceMonolayerAdsorptionSurface plasmon resonanceBacterial adhesinSelf-assembled monolayerBiophysicsCrystallographyNanotechnologyNanoparticleOrganic chemistryBiochemistryEscherichia coli

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Past work has shown that Treponema pallidum, the causative agent of syphilis, binds host fibronectin (FN). FN and other host proteins are believed to bind to rare outer membrane proteins (OMPs) of T. pallidum, and it is postulated that this interaction may facilitate cell attachment and mask antigenic targets on the surface. This research seeks to prepare a surface capable of mimicking the FN binding ability of T. pallidum in order to investigate the impact of FN binding with adsorbed Tp0483 on the host response to the surface. By understanding this interaction, it may be possible to develop more effective treatments for infection and possibly mimic the stealth properties of the bacteria. Functionalized self-assembled monolayers (SAMs) on gold were used to investigate rTp0483 and FN adsorption. Using a quartz crystal microbalance (QCM), rTp0483 adsorption and subsequent FN adsorption onto rTp0483 were determined to be higher on negatively charged carboxylate-terminated self-assembled monolayers (-COO(-) SAMs) compared to the other surfaces analyzed. Kinetic analysis of rTp0483 adsorption using surface plasmon resonance (SPR) supported this finding. Kinetic analysis of FN adsorption using SPR revealed a multistep event, where the concentration of immobilized rTp0483 plays a role in FN binding. An examination of relative QCM dissipation energy compared to the shift in frequency showed a correlation between the physical properties of adsorbed rTp0483 and SAM surface chemistry. In addition, AFM images of rTp0483 on selected SAMs illustrated a preference of rTp0483 to bind as aggregates. Adsorption on -COO(-) SAMs was more uniform across the surface, which may help further explain why FN bound more strongly. rTp0483 antibody studies suggested the involvement of amino acids 274-289 and 316-333 in binding between rTp0483 to FN, while a peptide blocking study only showed inhibition of binding with amino acids 316-333. Finally, surface adsorbed rTp0483 with FN bound significantly less anti-RGD and gelatin compared to FN adsorbed directly to -COO(-) SAMs, indicating that one or both binding regions may play a role in binding between rTp0483 and FN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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