Aberrant expression and demethylation of γ‐synuclein in colorectal cancer, correlated with progression of the disease
Notice bibliographique
Résumé
Recent evidence suggests that gamma-synuclein is abnormally expressed in a high percentage of tumor tissues of diversified cancer types, but rarely expressed in tumor-matched non-neoplastic adjacent tissues (NNAT). The molecular mechanism of CpG island demethylation may underlie aberrant gamma-synuclein expression. To fully understand the roles of aberrant gamma-synuclein expression and demethylation in the development of colorectal cancer (CRC), we examined the expression and methylation status of gamma-synuclein in 67 CRC samples, 30 NNAT samples, and five CRC cell lines as well. By using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), western blot, and immunohistochemistry analyses, gamma-synuclein expression was detected in both HT-29 and HCT116 cells, and was much higher in CRC samples than in NNAT samples (P < 0.05). The demethylating agent, 5-aza-2 cent-deoxycytidine, can induce re-expression of gamma-synuclein in COLO205, LoVo, and SW480 cells. Unmethylated gamma-synuclein alleles were detected in HT-29, HCT116, and LoVo cells by nested methylation-specific PCR, and the demethylated status of gamma-synuclein was much higher in CRC samples than in NNAT samples by real-time quantitative methylation-specific PCR (P < 0.05). The results of genomic bisulfite DNA sequencing further confirmed that the aberrant gamma-synuclein expression in CRC was primarily attributed to the demethylation of CpG island. The protein expression and demethylation status of gamma-synuclein in 67 CRC samples correlated with clinical stage, lymph node involvement, and distant metastasis. These findings suggest an involvement of aberrant gamma-synuclein expression and demethylation in progression of CRC, especially in advanced stages.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».