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Enregistrement W2025292090 · doi:10.1186/ar2349

Regulation of Sox9 activity by crosstalk with nuclear factor-κB and retinoic acid receptors

2008· article· en· W2025292090 sur OpenAlexafffund
Jason S. Rockel, Julie C. Kudirka, Andrew J Guzi, Suzanne M. Bernier

Notice bibliographique

RevueArthritis Research & Therapy · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensCanadian Institutes of Health ResearchWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Arthritis NetworkLady Davis Institute for Medical ResearchCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCrosstalkRetinoic acidRheumatologyReceptorRetinoic acid receptorNuclear receptorInternal medicineCancer researchMedicineTranscription factorEndocrinologyCell biologyChemistryBiologyGeneticsPhysicsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Sox9 and p300 cooperate to induce expression of cartilage-specific matrix proteins, including type II collagen, aggrecan and link protein. Tumour necrosis factor (TNF)-alpha, found in arthritic joints, activates nuclear factor-kappaB (NF-kappaB), whereas retinoic acid receptors (RARs) are activated by retinoid agonists, including all-trans retinoic acid (atRA). Like Sox9, the activity of NF-kappaB and RARs depends upon their association with p300. Separately, both TNF-alpha and atRA suppress cartilage matrix gene expression. We investigated how TNF-alpha and atRA alter the expression of cartilage matrix genes. METHODS: Primary cultures of rat chondrocytes were treated with TNF-alpha and/or atRA for 24 hours. Levels of transcripts encoding cartilage matrix proteins were determined by Northern blot analyses and quantitative real-time PCR. Nuclear protein levels, DNA binding and functional activity of transcription factors were assessed by immunoblotting, electrophoretic mobility shift assays and reporter assays, respectively. RESULTS: Together, TNF-alpha and atRA diminished transcript levels of cartilage matrix proteins and Sox9 activity more than each factor alone. However, neither agent altered nuclear levels of Sox9, and TNF-alpha did not affect protein binding to the Col2a1 48-base-pair minimal enhancer sequence. The effect of TNF-alpha, but not that of atRA, on Sox9 activity was dependent on NF-kappaB activation. Furthermore, atRA reduced NF-kappaB activity and DNA binding. To address the role of p300, we over-expressed constitutively active mitogen-activated protein kinase kinase kinase (caMEKK)1 to increase p300 acetylase activity. caMEKK1 enhanced basal NF-kappaB activity and atRA-induced RAR activity. Over-expression of caMEKK1 also enhanced basal Sox9 activity and suppressed the inhibitory effects of TNF-alpha and atRA on Sox9 function. In addition, over-expression of p300 restored Sox9 activity suppressed by TNF-alpha and atRA to normal levels. CONCLUSION: NF-kappaB and RARs converge to reduce Sox9 activity and cartilage matrix gene expression, probably by limiting the availability of p300. This process may be critical for the loss of cartilage matrix synthesis in inflammatory joint diseases. Therefore, agents that increase p300 levels or activity in chondrocytes may be useful therapeutically.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,302
Score d'incertitude au seuil0,674

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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