Genome sequencing of linezolid-resistant <i>Streptococcus pneumoniae</i> mutants reveals novel mechanisms of resistance
Notice bibliographique
Résumé
Linezolid is a member of a novel class of antibiotics, with resistance already being reported. We used whole-genome sequencing on three independent Streptococcus pneumoniae strains made resistant to linezolid in vitro in a step-by-step fashion. Analysis of the genome assemblies revealed mutations in the 23S rRNA gene in all mutants including, notably, G2576T, a previously recognized resistance mutation. Mutations in an additional 31 genes were also found in at least one of the three sequenced genomes. We concentrated on three new mutations that were found in at least two independent mutants. All three mutations were experimentally confirmed to be involved in antibiotic resistance. Mutations upstream of the ABC transporter genes spr1021 and spr1887 were correlated with increased expression of these genes and neighboring genes of the same operon. Gene inactivation supported a role for these ABC transporters in resistance to linezolid and other antibiotics. The hypothetical protein spr0333 contains an RNA methyltransferase domain, and mutations within that domain were found in all S. pneumoniae linezolid-resistant strains. Primer extension experiments indicated that spr0333 methylates G2445 of the 23S rRNA and mutations in spr0333 abolished this methylation. Reintroduction of a nonmutated version of spr0333 in resistant bacteria reestablished G2445 methylation and led to cells being more sensitive to linezolid and other antibiotics. Interestingly, the spr0333 ortholog was also mutated in a linezolid-resistant clinical Staphylococcus aureus isolate. Whole-genome sequencing and comparative analyses of S. pneumoniae resistant isolates was useful for discovering novel resistance mutations.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».