Conservation of RET proto-oncogene splicing variants and implications for RET isoform function
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Notice bibliographique
Résumé
The RET proto-oncogene encodes a receptor tyrosine kinase required for development of the kidney and neural crest-derived cell types. Alternative splicing of the 3' exons of human RET results in three protein isoforms with distinct C-termini: RET9, RET51, and RET43. These RET isoforms show differential binding to downstream adapter molecules, suggesting they may have distinct signaling functions. We have characterized Ret 3' sequences in mouse and investigated alternative splicing of this region. We found that the organization of Ret 3' sequences is very similar to human RET. The mouse locus also has alternatively spliced C-terminal coding regions, and the sequences corresponding to RET9 and RET51 are highly conserved in both position and sequence with the human locus. Further, we compared the predicted C-terminal amino acids of RET9 and RET51 in seven vertebrate species, and found that they are well conserved. We have identified sequence encoding a putative ret43 isoform in mouse, however the predicted amino acid sequence showed low homology to human RET43. Our data suggest that RET isoforms are evolutionarily highly conserved over a broad range of species, which may indicate that each isoform has a distinct role in normal RET function.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle