Molecular characterization and antibiotic resistance of Salmonella in children with acute gastroenteritis in Abuja, Nigeria
Notice bibliographique
Résumé
INTRODUCTION: In Nigeria, acute gastroenteritis in children under five years of age is a major cause of mortality and morbidity; identification and characterization of microbial agents of acute gastroenteritis, including Salmonella, remains a powerful tool for effective management, surveillance, and control. METHODOLOGY: Diarrheal stool samples were directly plated onto differential and selective media to isolate Salmonella. Extended-spectrum beta-lactamases were screened using the double disk diffusion technique and by PCR targeting the blaTEM and blaCTX-M genes. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) was performed usingthe PulseNet Canada Laboratory protocol for molecular subtyping using the restriction enzymes XbaI and BlnI. RESULTS: The serotypes identified were Salmonella enterica serovar Zanzibar (n = 5), Salmonella Brancaster (n = 3), and one isolate of Salmonella Enteritidis (phage type 1). The following levels of resistance were found among the Salmonella strains: amoxicillin, five strains (55.6%); amoxicillin-clavulanic acid, two strains (22.2%); cephalexin, five strains (55.6%); and cefuroxime, five strains (55.6%). Intermediate resistance was found in five strains (55.6%) only to amoxicillin-clavulanic acid. All isolates were susceptible to nalidixic acid, ciprofloxacin, and ceftriaxone, and no ESBL-producing Salmonella were detected. CONCLUSIONS: Our findings demonstrated the involvement of three Salmonella serovars in acute gastroenteritis; resistance to penicillins and cephalosporins was common.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».