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Enregistrement W2025708403 · doi:10.1111/j.1365-2435.2006.01150.x

Rapid detection of fungal endophytes in grasses for large‐scale studies

2006· article· en· W2025708403 sur OpenAlexaff
Saewan Koh, Mark Vicari, John P. Ball, Tomo Rakocevic, Shahram Zaheer, David S. Hik, Dawn R. Bazely

Notice bibliographique

RevueFunctional Ecology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and fungal interactions
Établissements canadiensYork UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeotyphodiumBiologyEndophyteLolium perenneFestuca arundinaceaFestucaBotanyEpichloëPoaceaeLoliumPlant use of endophytic fungi in defenseAgronomySymbiosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Standard visual screening methods for determining the qualitative and quantitative presence of fungal endophytes are too time‐consuming for large‐scale ecological studies. We investigated whether commercially available immunoblot kits, using monoclonal antibody techniques and designed for rapid‐screening of the presence of Neotyphodium endophytes in fresh samples of the pasture grasses Festuca arundinacea and Lolium perenne , could be used for Neotyphodium detection using other grasses and preserved samples. We also determined whether immunoblot kits could provide quantitative information about the amount of Neotyphodium in the grass. The kits accurately detected endophyte presence in F. rubra , F. ovina , F. pratensis and F. altaica , in both preserved samples (dried and fixed), including 12‐year‐old stored, dried samples of F. rubra . Endophytes were detected in 7‐day‐old seedlings of Lolium perenne , 3 days (30%) earlier than previously recognized. The intensity of the coloured tissue prints on scanned immunoblot cards was significantly positively correlated with hyphal density, demonstrating a previously unrecognized accurate quantitative application. These findings greatly reduce logistical barriers to large‐scale field research into the broader ecological significance of Neotyphodium in temperate and arctic grasses in non‐agricultural ecosystems (particularly in remote areas) and suggest potential for estimating historical infection rates using stored and herbarium specimens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,678
Score d'incertitude au seuil0,976

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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