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Enregistrement W2025804527 · doi:10.1074/jbc.m111.287128

SATB Homeobox Proteins Regulate Trophoblast Stem Cell Renewal and Differentiation

2011· article· en· W2025804527 sur OpenAlexfundno aff
Kazuo Asanoma, Kaiyu Kubota, Damayanti Chakraborty, Stephen J. Renaud, Norio Wake, Kotaro Fukushima, Michael J. Soares, M. A. Karim Rumi

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchHospital for Sick ChildrenLalor FoundationAmerican Heart Association
Mots-clésBiologyCell biologyTranscription factorCellular differentiationEctopic expressionHomeoboxStem cellTrophoblastGene knockdownMolecular biologyCell cultureGeneticsPlacentaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The morphogenesis of the hemochorial placenta is dependent upon the precise expansion and differentiation of trophoblast stem (TS) cells. SATB homeobox 1 (SATB1) and SATB2 are related proteins that have been implicated as regulators of some stem cell populations. SATB1 is highly expressed in TS cells, which prompted an investigation of SATB1 and the related SATB2 as regulators of TS cells. SATB1 and SATB2 were highly expressed in rat TS cells maintained in the stem state and rapidly declined following induction of differentiation. SATB proteins were also present within the rat placenta during early stages of its morphogenesis and disappeared as gestation advanced. Silencing Satb1 or Satb2 expression decreased TS cell self-renewal and increased differentiation, whereas ectopic expression of SATB proteins promoted TS cell expansion and blunted differentiation. Eomes, a key transcriptional regulator of TS cells, was identified as a target for SATB proteins. SATB knockdown decreased Eomes transcript levels and promoter activity, whereas SATB ectopic expression increased Eomes transcript levels and promoter activity. Electrophoretic mobility shift assay as well as chromatin immunoprecipitation analyses demonstrated that SATB proteins physically associate with a regulatory site within the Eomes promoter. We conclude that SATB proteins promote TS cell renewal and inhibit differentiation. These actions are mediated in part by regulating the expression of the TS cell stem-associated transcription factor, EOMES.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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