Abstract 93: Defining the roles of COIL and WIPI1 in breast cancer metastasis
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Metastasis of cancerous cells to distant sites is the major cause of death from breast cancer. In a previous study, we performed aCGH on breast invasive duct carcinoma samples with and without lymph node metastases and identified regions of genomic amplification that are associated with lymph node metastasis. These were subsequently validated by q-PCR. Within the 17q22-24 region, we have identified four genes likely to contribute to metastasis based on published data: COIL, WIPI1, TMEM100, and SLC16A6. We are using RNAi and ectopic over-expression to characterize these genes with in vitro functional assays for proliferation, migration, invasion, and survival. We used qRT-PCR analysis on a panel of seven breast cancer cell lines of varying invasiveness: MDA-MB-157, MDA-MB-231, MDA-MB-468, BT-549, CAMA-1, HS578T, MCF-7, and SKBR-3. We identified that WIPI1 and COIL were expressed in the majority. WIPI1 is up-regulated in a variety of tumor cells; studies suggest WIPI1 can activate autophagy by suppressing TORC1. Autophagy can inhibit cancer by maintaining genome stability via disposing of damaged mitochondria and peroxisomes. In clinical data obtained from 298 breast cancer patients, we observed high expression of WIPI1 to be associated with higher survival and lower breast cancer relapse. Alternatively, autophagy can also provide a survival mechanism for tumors with restricted blood supply and resistance to chemotherapy. This is in agreement with our observation of high WIPI1 protein expression in highly invasive breast cancer cell lines. We are over-expressing WIPI1 in SKBR-3 and knocking it down in BT-549 in vitro. WIPI1 could help determine the role of autophagy in tumor initiation processes such as proliferation and invasion, and in maintenance of tumor cells following therapy. COIL is found in a diffuse nucleoplasmic pool and in Cajal bodies (CBs). The role of diffuse COIL is still unclear, but CBs, involved in the formation of macromolecular complexes and found more in cells with high transcriptional activity, require COIL for proper formation and localization. We observed high expression of COIL protein in cell lines with higher proliferation index, noticeably in ER positive cell lines such as CAMA1 and absence in a non-tumorogenic cell line MCF10A. We are investigating the association of COIL with proliferation, invasion and migration abilities by over-expression and knockdown of the COIL protein in MDA231 and MCF7 breast cancer cells. We found from clinical data obtained from 245 breast cancer patients that high expression of COIL resulted in lower survival and a higher risk of relapse. This suggests that COIL may be a potential therapeutic target. Citation Format: {Authors}. {Abstract title} [abstract]. In: Proceedings of the 103rd Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2012 Mar 31-Apr 4; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2012;72(8 Suppl):Abstract nr 93. doi:1538-7445.AM2012-93
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
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Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».