Vernalization-induced changes of the DNA methylation pattern in winter wheat
Notice bibliographique
Résumé
Vernalization is a cold treatment that induces or accelerates flowering and insures that temperate-zone plants will not flower until after winter. There is evidence that vernalization results in DNA demethylation that induces flowering. Differences in DNA methylation can be determined using methylation-sensitive amplified fragment length polymorphisms (AFLPs). Methylation-sensitive AFLPs utilize restriction enzyme isoschizomers that are differentially sensitive to methylation, producing polymorphisms related to methylation differences as opposed to sequence differences. Near-isogenic lines (NILs) have been developed for spring vs. winter habit in wheat (Triticum aestivum) and allow for the study of a single vernalization locus. In this study, differences in the methylation pattern were determined for spring and winter NILs, as well as for unvernalized and vernalized individuals. Winter wheat was more highly methylated than spring wheat and methylation-related AFLPs were produced between winter and spring wheat. Changes in the methylation pattern were observed at the end of vernalization, one week after the end of vernalization, and four weeks after the end of vernalization of winter wheat. However, the most methylation differences were observed one week after removal of winter wheat from cold treatment. Our data suggest that there is not only a vernalization-induced demethylation related to flower induction, but there is also a more general and non-specific demethylation of sequences unrelated to flowering. Two methylation-related AFLPs induced by vernalization were shared among all of the winter NILs.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».