Evolutionary and Physiological Variation in Cardiac Troponin C in Relation to Thermal Strategies of Fish
Notice bibliographique
Résumé
Striated muscle contraction is initiated when troponin C (TnC) binds Ca(2+), which activates actinomyosin ATPase. We investigated (i) the variation between cardiac TnC (cTnC) primary structure within teleost fish and (ii) the pattern of TnC expression in response to temperature acclimation. There were few differences between rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), yellowfin tuna (Thunnus albacares), yellow perch (Perca flavescens), goldfish (Carassius auratus), white sucker (Catostomus commersoni), and icefish (Chaenocephalus aceratus) in cTnC amino acid sequence. No variation existed in the regulatory Ca(2+)-binding site (site 2). The site 3 and 4 substitutions were limited to residues not directly involved in Ca(2+) coordination. Fish cTnC primary structure was highly conserved between species (93%-98%) and collectively divergent from the highly conserved sequence seen in birds and mammals. Northern blots and polymerase chain reaction showed that thermal acclimation of trout (3 degrees, 18 degrees C) did not alter the TnC isoform pattern. While cardiac and white muscle had the expected isoforms-cTnC and fast troponin C (fTnC), respectively-red muscle unexpectedly expressed primarily ftnC. Cold acclimation did not alter myofibrillar ATPase Ca(2+) sensitivity, but maximal velocity increased by 60%. We found no evidence that TnC variants, arising between species or in response to thermal acclimation, play a major role in mitigating the effects of temperature on contractility of the adult fish heart.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».