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Enregistrement W2026149521 · doi:10.1089/aid.2006.22.648

Serial Evolution of TCR <i>β</i> Chain Transcript Mobilization in HIV Type-1-Infected Patients Following Vaccine Immune Stimulation and HAART Interruption

2006· article· en· W2026149521 sur OpenAlexaff
Marina Guillet, Muriel Andrieu, Cécile Braudeau, Catherine Ruiz, Annaïck Pallier, Bénédicte Charmeteau, Joëlle Véziers, Neal L. Oden, Nelly Bonilla, Sophie Brouard, Jean‐Gérard Guillet, Jean‐Paul Soulillou

Notice bibliographique

RevueAIDS Research and Human Retroviruses · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensHotel Dieu Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesImmune Tolerance NetworkUniversity of California, San FranciscoStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésT-cell receptorCD8Immune systemBiologyImmunologyVaccinationVirologyImmunopathologyT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this article, we studied the T cell receptor (TCR)beta chain transcript mobilization in peripheral blood lymphocytes harvested from HIV-1-infected patients before and after vaccination with a mixture of six lipopeptides and at the moment and serially after highly active antiretroviral therapy (HAART) interruption. This study was performed by using a combined qualitative and quantitative assessment of Vbeta mRNA alterations at the level of complementary determining region 3 length distribution (CDR3-LD) of the TCR. Whereas healthy individuals displayed both stable CDR3-LD profiles and Vbeta transcript accumulations over time, the four HIV-1-infected patients in a quiescent disease phase under HAART have a highly significantly biased CDR3-LD. In addition, they displayed a significant further increase of alterations of their beta CDR3-LD profile after vaccination and both a more altered CDR3-LD (p < 0.05) and an increased transcript accumulation of some Vbeta families after HAART interruption. These modifications mostly concerned the CD8(+ve) T cells. Such a global approach of TCR alterations may help to follow the immune response of these patients and allow targeting of more complex in vivo studies by identifying the T cells with a selected repertoire.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,262
Score d'incertitude au seuil0,455

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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