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Enregistrement W2026245214 · doi:10.1002/art.22301

Sex and ethnic differences in the association of <i>ASPN</i>, <i>CALM1</i>, <i>COL2A1</i>, <i>COMP</i>, and <i>FRZB</i> with genetic susceptibility to osteoarthritis of the knee

2006· article· en· W2026245214 sur OpenAlexaff
Ana M. Valdes, John Loughlin, Mark Van Oene, Kay Chapman, Gabriela Surdulescu, Michael Doherty, Tim D. Spector

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatism · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOsteoarthritis Treatment and Mechanisms
Établissements canadiensAlethia Biotherapeutics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHaplotypeMedicineSingle-nucleotide polymorphismOdds ratioOsteoarthritisCase-control studyInternal medicineSNPGenetic predispositionGenotypeAlleleAllele frequencyGeneticsPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To assess whether the association of genetic polymorphisms with osteoarthritis (OA) in other populations could be replicated in a large, multicenter, mixed-sex, case-control study of clinical knee OA. METHODS: Genetic polymorphisms in OA candidate genes were genotyped in 298 men and 305 women, ages 50-86 years, all of whom had a diagnosis of knee OA as assessed clinically and radiographically, and in 300 male and 299 female control subjects matched for age and ethnicity. Allele and haplotype frequencies for 5 genes (ASPN, CALM1, COL2A1, COMP, and FRZB) previously tested for association with hip and/or knee OA in other populations were compared between patients and control subjects, analyzing men and women separately. RESULTS: The same FRZB 2-marker single-nucleotide polymorphism (SNP) haplotype associated with hip OA in other populations of Caucasian women was shown to increase the risk of knee OA among the women (but not the men) in the current study (odds ratio [OR] 2.87, P < 0.04). The CALM1 SNP, which affects the risk of hip OA in Japanese individuals, was not shown to be associated with susceptibility to OA in men or women. COL2A1 haplotypes were demonstrated to be associated with a decreased risk of knee OA in men (OR 0.68, P < 0.005) but not in women. COMP haplotypes that were associated with susceptibility to knee OA were different in men and women (P < 0.014 and P < 0.032, respectively). A meta-analysis of these data and those from previously published reports indicated a strong association between the FRZB G324 allele (P < 0.0003) and suggested that an ASPN allele is protective against the risk of knee OA in Caucasians (P < 0.02). CONCLUSION: Our results indicate that genetic polymorphisms affecting knee OA vary between populations (Japanese versus Caucasian) and sexes and indicate a role for ASPN, COMP, FRZB, and COL2A1 in Caucasians.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,198
Score d'incertitude au seuil0,899

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations202
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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