Characterization of intact lipopolysaccharides from the <b><i>Haemophilus influenzae</i></b> strain RM 118 using electrophoresis‐assisted open‐tubular liquid chromatography‐mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
We have applied an electrophoresis-assisted open-tubular LC-MS method for analyzing intact lipopolysaccharides (LPSs) from Haemophilus influenzae strain RM118 (Rd). We were able to obtain structural information on both core oligosaccharides (OSs) and the lipid A moiety including the sialylation, glycylation, and the distribution of fatty acid residues on the disaccharide backbone of lipid A. The fragmentation patterns of sodiated and protonated LPS molecules were investigated for determining the location of sialic acid. It was found that the tandem mass spectra of sodiated ions provided unambiguous evidence of both sialylated lactose and sialylated lacto-N-neotetraose. In contrast, the fragment ions of protonated ions only offered the evidence for the existence of sialylated lacto-N-neotetraose. The lipid A of Gram-negative bacteria, as the principal endotoxic component of LPS, plays a major role in the pathogenesis of bacterial infections. We have previously characterized lipid A species after mild acid hydrolysis of LPS during which lipid A precipitates. In this study, intact LPS was directly introduced to a tandem mass spectrometer. In-source dissociation strategy was employed, followed by multiple-stage MS/MS on the ions originating from the lipid part to obtain structural information. This is the first time that the structure of lipid A of H. influenzae was characterized by MS/MS on intact LPS molecules without any prior chemical modifications. In the same way information on the OS can be obtained by MS/MS by focusing on ions originating from core OS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».