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Enregistrement W2026406760 · doi:10.4061/2011/539762

On the Involvement of Copper Binding to the N‐Terminus of the Amyloid Beta Peptide of Alzheimer′s Disease: A Computational Study on Model Systems

2011· article· en· W2026406760 sur OpenAlexafffund
Samira Azimi, Arvi Rauk

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Alzheimer s Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaWestern Canada Research Grid
Mots-clésPeptideCopperBinding affinitiesAffinitiesAmyloid betaChemistryAmideCrystallographyStereochemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Density functional and second order Moller-Plesset perturbation theoretical methods, coupled with a polarizable continuum model of water, were applied to determine the structures, binding affinities, and reduction potentials of Cu(II) and Cu(I) bound to models of the Asp1, Ala2, His6, and His13His14 regions of the amyloid beta peptide of Alzheimer's disease. The results indicate that the N-terminal Asp binds to Cu(II) together with His6 and either His13 or His14 to form the lower pH Component I of Aβ. Component II of Aβ is the complex between Cu(II) and His6, His13, and His14, to which an amide O (of Ala2) is also coordinated. Asp1 does not bind to Cu(II) if three His residues are attached nor to any Cu(I) species to which one or more His residues are bound. The most stable Cu(I) species is one in which Cu(I) bridges the N(δ) of His13 and His14 in a linear fashion. Cu(I) binds more strongly to Aβ than does Cu(II). The computed reduction potential that closely matches the experimental value for Cu(II)/Aβ corresponds to reduction of Component II (without Ala2) to the Cu(I) complex after endergonic attachment of His6.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,459
Score d'incertitude au seuil0,530

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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