Crossroads between Bacterial and Mammalian Glycosyltransferases
Notice bibliographique
Résumé
Bacterial glycosyltransferases (GT) often synthesize the same glycan linkages as mammalian GT; yet, they usually have very little sequence identity. Nevertheless, enzymatic properties, folding, substrate specificities, and catalytic mechanisms of these enzyme proteins may have significant similarity. Thus, bacterial GT can be utilized for the enzymatic synthesis of both bacterial and mammalian types of complex glycan structures. A comparison is made here between mammalian and bacterial enzymes that synthesize epitopes found in mammalian glycoproteins, and those found in the O antigens of Gram-negative bacteria. These epitopes include Thomsen-Friedenreich (TF or T) antigen, blood group O, A, and B, type 1 and 2 chains, Lewis antigens, sialylated and fucosylated structures, and polysialic acids. Many different approaches can be taken to investigate the substrate binding and catalytic mechanisms of GT, including crystal structure analyses, mutations, comparison of amino acid sequences, NMR, and mass spectrometry. Knowledge of the protein structures and functions helps to design GT for specific glycan synthesis and to develop inhibitors. The goals are to develop new strategies to reduce bacterial virulence and to synthesize vaccines and other biologically active glycan structures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».