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Enregistrement W2026449098 · doi:10.1104/pp.110.165431

mEosFP-Based Green-to-Red Photoconvertible Subcellular Probes for Plants 

2010· article· en· W2026449098 sur OpenAlexafffund
Jaideep Mathur, Resmi Nath Radhamony, Alison M. Sinclair, Ana Donoso, Natalie Dunn, Elyse J. Roach, Devon Radford, P. S. Mohammad Mohaghegh, David C. Logan, Ksenija Kokolic, Neeta Mathur

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePhotosynthetic Processes and Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of HealthUniversité de LausanneUniversity of SouthamptonOxford Brookes UniversityInstitut National de la Recherche AgronomiqueUniversity of Saskatchewan
Mots-clésGreen fluorescent proteinEndomembrane systemFluorescence recovery after photobleachingOrganelleCell biologyGolgi apparatusEndoplasmic reticulumYellow fluorescent proteinLive cell imagingFluorescenceProtein subcellular localization predictionBiologyPhotobleachingSubcellular localizationAequorea victoriaVesicleBiophysicsBiochemistryCytoplasmCellMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Photoconvertible fluorescent proteins (FPs) are recent additions to the biologists' toolbox for understanding the living cell. Like green fluorescent protein (GFP), monomeric EosFP is bright green in color but is efficiently photoconverted into a red fluorescent form using a mild violet-blue excitation. Here, we report mEosFP-based probes that localize to the cytosol, plasma membrane invaginations, endosomes, prevacuolar vesicles, vacuoles, the endoplasmic reticulum, Golgi bodies, mitochondria, peroxisomes, and the two major cytoskeletal elements, filamentous actin and cortical microtubules. The mEosFP fusion proteins are smaller than GFP/red fluorescent protein-based probes and, as demonstrated here, provide several significant advantages for imaging of living plant cells. These include an ability to differentially color label a single cell or a group of cells in a developing organ, selectively highlight a region of a cell or a subpopulation of organelles and vesicles within a cell for tracking them, and understanding spatiotemporal aspects of interactions between similar as well as different organelles. In addition, mEosFP probes introduce a milder alternative to fluorescence recovery after photobleaching, whereby instead of photobleaching, photoconversion followed by recovery of green fluorescence can be used for estimating subcellular dynamics. Most importantly, the two fluorescent forms of mEosFP furnish bright internal controls during imaging experiments and are fully compatible with cyan fluorescent protein, GFP, yellow fluorescent protein, and red fluorescent protein fluorochromes for use in simultaneous, multicolor labeling schemes. Photoconvertible mEosFP-based subcellular probes promise to usher in a much higher degree of precision to live imaging of plant cells than has been possible so far using single-colored FPs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil0,737

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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