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Enregistrement W2026634149 · doi:10.1094/pdis-12-11-1045-re

Occurrence and Genetic Diversity of Winona-Like <i>Plum pox virus</i> Isolates in Russia

2012· article· en· W2026634149 sur OpenAlexaffabout
Anna Sheveleva, Ivanov Pa, Yuri Prihodko, D. James, Sergei Chirkov

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogenetic treeGenetic diversityPrunusVirologyPlant virusPhylogeneticsPolymerase chain reactionPotyviridaeCladePotyvirusVirusGeneBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In studying the distribution and genetic diversity of Plum pox virus (PPV) in Russia, over a dozen new PPV isolates belonging to the strain Winona (PPV-W) were identified by immunocapture reverse-transcription polymerase chain reaction with the PPV-W-specific primers 3174-SP-F3/3174-SP-R1. Isolates were detected in two geographically distant regions of European Russia (Northern Caucasus and Moscow regions) in naturally infected plum (Prunus domestica), blackthorn (P. spinosa), Canadian plum (P. nigra), and downy cherry (P. tomentosa). The new PPV-W isolates were shown to be serologically related but not identical by triple-antibody sandwich enzyme-linked immunosorbent assay and Western blotting analysis using the monoclonal antibody (MAb) 5B-IVIA and MAbs specific to the N-terminal epitopes of PPV-W isolate 3174. Analysis of nucleotide and deduced amino acid sequences of the (C-ter)NIb-(N-ter)CP genome region indicate great genetic diversity among isolates, with phylogenetic analysis revealing seven clades. Isolates P1 and P3 found in plum in the south of Russia clustered closely with the putative ancestral PPV-W isolate LV-145bt from Latvia, while isolate 1410-7 found in P. nigra in Moscow appears to be closely related to the Canadian isolate W3174. The data obtained indicate wide dissemination of PPV-W isolate in stone fruit in the European part of the former USSR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,156

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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