Confirmation that “Brachyspira hampsonii” clade I (Canadian strain 30599) causes mucohemorrhagic diarrhea and colitis in experimentally infected pigs
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: "Brachyspira hampsonii", discovered in North America in 2010 associated with dysentery-like illness, is an economically relevant swine pathogen resulting in decreased feed efficiency and increased morbidity, mortality and medication usage. "B. hampsonii" clade II strain 30446 has been shown to be causally associated with mucohemorrhagic diarrhea and colitis. Our objectives were to determine if "Brachyspira hampsonii" clade I strain 30599 is pathogenic to pigs, and to evaluate the relative diagnostic performance of three ante mortem sampling methodologies (direct PCR on feces, PCR on rectal GenoTube Livestock swabs, Brachyspira culture from rectal swabs). Five-week old pigs were intragastrically inoculated thrice with 108 genomic equivalents "B. hampsonii" (n = 12), or served as sham controls (n = 6). Feces were sampled and consistency assessed daily. Necropsies were performed 24 h after peak clinical signs. RESULTS: One pig died due to unrelated illness. Nine of 11 inoculated pigs, but no controls, developed mucoid or mucohemorrhagic diarrhea (MHD). Characteristic lesions of swine dysentery were observed in large intestine. "B. hampsonii" strain 30599 DNA was detected by qPCR in feces of all inoculated pigs for up to 6 days prior to the onset of MHD. The organism was isolated from the feces and colons of pigs demonstrating MHD, but not from controls. B. intermedia was isolated from inoculated pigs without MHD, and from 5 of 6 controls. CONCLUSIONS: We conclude that "Brachyspira hampsonii" clade I strain 30599 is pathogenic and causes mucohemorrhagic diarrhea and colitis in susceptible pigs. Moreover, the three sampling methodologies performed similarly. GenoTube Livestock, a forensic swab designed to preserve DNA during shipping is a useful tool especially in settings where timely transport of diagnostic samples is challenging.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».