2G12-Expressing B Cell Lines May Aid in HIV Carbohydrate Vaccine Design Strategies
Notice bibliographique
Résumé
The highly conserved cluster of high-mannose glycans on the HIV-1 envelope glycoprotein, gp120, has been highlighted as a target for neutralizing antibodies. 2G12, the first HIV-1 antiglycan neutralizing antibody described, binds with an unusual domain-exchanged structure that creates a high-affinity multivalent binding surface. It is an interesting challenge for rational vaccine design to generate immunogens capable of eliciting domain-exchanged 2G12-like responses. We recently showed that di-mannose recognition by the variable domains of 2G12 is independent of domain exchange but that exchange is critical for virus neutralization. Carbohydrate-based immunogens aimed at inducing 2G12-like antibodies may need to drive both di-mannose recognition and domain exchange through interactions with B cell receptors. Here we assessed the ability of such immunogens to activate mouse B cell lines displaying domain-exchanged wild-type 2G12 (2G12 WT), a non-domain-exchanged Y-shaped variant (2G12 I19R), and germ line 2G12 (2G12 gl). We show that several immunogens, including heat-killed yeast and bacteria, can activate both 2G12 WT and 2G12 I19R B cells. However, only discrete clusters of high-mannose glycans, as on recombinant forms of the HIV-1 envelope trimer and oligodendrons, activate 2G12 WT B cells. Furthermore, no immunogen tested activated 2G12 gl cells. Our results support the hypothesis that in order to drive domain exchange of an antimannose antibody response, a boost with an immunogen displaying discrete clusters of high-mannose glycans not recognized by conventional Y-shaped antibodies will be required. Additionally, a molecule capable of activating 2G12 gl cells might also be required. The results highlight broadly neutralizing antibody-expressing mouse B cells as potentially useful tools for carbohydrate immunogen screening.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».