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Enregistrement W2027095388 · doi:10.1177/09680519020080010301

Identification of genes involved in biosynthesis of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 1 O-antigen and biological properties of rough mutants

2002· article· en· W2027095388 sur OpenAlexafffund
Josée Labrie, Stéphane Rioux, Mary Margaret Wade, Franklin R. Champlin, Steven C. Holman, W. William Wilson, C Savoye, Marylène Kobisch, Marc Sirois, Catherine Galarneau, Mario Jacques

Notice bibliographique

RevueJournal of Endotoxin Research · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensUniversité du Québec à Trois-RivièresCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésActinobacillus pleuropneumoniaeMicrobiologyBiologyMutantSerotypeVirulenceGeneORFSActinobacillusVirologyGeneticsPeptide sequenceOpen reading frameBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Actinobacillus pleuropneumoniae is an important pathogen of swine. Lipopolysaccharide (LPS) has been identified as the major adhesin of A. pleuropneumoniae and it is involved in adherence to porcine respiratory tract cells. We previously generated seven rough LPS mutants of A. pleuropneumoniae serotype 1 by using a mini-Tn10 transposon mutagenesis system [Rioux S, Galarneau C, Harel J et al. Isolation and characterization of mini-Tn10 lipopolysaccharide mutants of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 1. Can J Microbiol 1999; 45: 1017-1026]. The purpose of the present study was to characterize these mutants in order to learn more about LPS O-antigen biosynthesis genes and their organization in A. pleuropneumoniae, and to determine the surface properties and virulence in pigs of these isogenic mutants. By mini-Tn10 insertions in rough mutants, four putative genes (ORF12, ORF16, ORF17, and ORF18) involved in O-antigen biosynthesis in A. pleuropneumoniae serotype 1 were found within a region of 18 ORFs. This region is homologous to the gene cluster of serotype-specific O-polysaccharide biosynthesis from A. actinomycetemcomitans strain Y4 (serotype b). Two mutants showed homology to a protein with identity to glycosyltransferases (ORF12); two others had the mini-Tn10 insertion localized in genes encoding for two distinct proteins with identity to rhamnosyltransferases (ORF16 and ORF17) and three showed homology to a protein which is known to initiate polysaccharide synthesis (ORF18). These four ORFs were also present in A. pleuropneumoniae serotypes 9 and 11 that express an O-antigen that serologically cross-reacts with serotype 1. Evaluation of some biological properties of rough mutants seems to indicate that the absence of O-chains does not appear to have an influence on the virulence of the bacteria in pigs and on the overall surface hydrophobicity, charge and hemoglobin-binding activity, or on LAL activation. An acapsular mutant was included in the present study in order to compare the influence of O-chains and capsule polysaccharides on different cell surface properties. Our data suggest that capsular polysaccharides and not O-chains polysaccharides have a major influence on surface properties of A. pleuropneumoniae serotype 1 and its virulence in pigs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,344

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,167
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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