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Enregistrement W2027174505 · doi:10.1139/g10-069

Mechanisms of magnesium amelioration of aluminum toxicity in soybean at the gene expression level

2010· article· en· W2027174505 sur OpenAlexvenueno aff
Dechassa Duressa, K. M. Soliman, Dongquan Chen

Notice bibliographique

RevueGenome · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAluminum toxicity and tolerance in plants and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGene expressionGeneBiologyToxicityTranscriptomeMagnesiumDNA microarrayGenotypeDownregulation and upregulationTranscription (linguistics)Molecular biologyGeneticsChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Micromolar concentration of magnesium (Mg) in culture solution is known to ameliorate aluminum (Al) toxicity in soybean and other leguminous species. To advance the understanding of this phenomenon at the level of gene expression in soybean, we undertook a comparative transcriptome analysis using DNA microarrays and Al-tolerant and Al-sensitive genotypes treated with Al ions alone or Al plus Mg ions. We observed a more rapid alteration of transcription for Al-tolerant than Al-sensitive soybean after introduction of Mg into Al-containing medium, but at 72 h, far more genes were altered (both upregulated and downregulated) in the Al-sensitive line, reflecting the known greater saving effect of Mg for Al-sensitive than Al-tolerant lines. Mg appears to ameliorate Al toxicity in the sensitive genotype by the dual mechanisms of (i) specifically increasing the expression level of several genes that are upregulated in the Al-treated, Al-tolerant genotype in the absence of Mg and (ii) possibly saving energy by decreasing expression of most genes relative to expression under Al stress. Mg-mediated reduction in gene expression also appears to be an important mechanism of Mg protection of the Al-tolerant genotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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