SSR marker diversity of soybean aphid resistance sources in North America
Notice bibliographique
Résumé
The soybean aphid (Aphis glycines Matsumura) has become a major pest of soybean in North America since 2000. Seven aphid resistance sources, PI 71506, Dowling, Jackson, PI 567541B, PI 567598B, PI 567543C, and PI 567597C, have been identified. Knowledge of genetic relationships among these sources and their ancestral parents will help breeders develop new cultivars with different resistance genes. The objective of this research was to examine the genetic relationships among these resistance sources. Sixty-one lines were tested with 86 simple sequence repeat (SSR) markers from 20 linkage groups. Non-hierarchical (VARCLUS) and hierarchical (Ward's) clustering and multidimensional scaling (MDS) were used to determine relationships among the 61 lines. Two hundred and sixty-two alleles of the 86 SSR loci were detected with a mean polymorphism information content of 0.36. The 61 lines were grouped into 4 clusters by both clustering methods and the MDS results consistently corresponded to the assigned clusters. The 7 resistance sources were clustered into 3 different groups corresponding to their geographical origins and known pedigree information, indicating genetic differences among these sources. The largest variation was found among individuals within different clusters by analysis of molecular variance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».