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Enregistrement W2027304858 · doi:10.1074/jbc.m112.360859

Hydrophobic Imbalance in the Cytoplasmic Domain of Phospholamban Is a Determinant for Lethal Dilated Cardiomyopathy

2012· article· en· W2027304858 sur OpenAlexafffund
Delaine K. Ceholski, Catharine A. Trieber, Howard S. Young

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensNational Institute for NanotechnologyUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPhospholambanSERCAMutantCytoplasmMutationDilated cardiomyopathyEndoplasmic reticulumBiologyCell biologyWild typeContractilityCardiomyopathyChemistryATPaseBiochemistryInternal medicineEndocrinologyHeart failureMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sarco(endo)plasmic reticulum calcium ATPase (SERCA) and its regulatory partner phospholamban (PLN) are essential for myocardial contractility. Arg(9) → Cys (R9C) and Arg(14) deletion (R14del) mutations in PLN are associated with lethal dilated cardiomyopathy in humans. To better understand these mutations, we made a series of amino acid substitutions in the cytoplasmic domain of PLN and tested their ability to inhibit SERCA. R9C is a complete loss-of-function mutant of PLN, whereas R14del is a mild loss-of-function mutant. When combined with wild-type PLN to simulate heterozygous conditions, the mutants had a dominant negative effect on SERCA function. A series of targeted mutations in this region of the PLN cytoplasmic domain ((8)TRSAIRR(14)) demonstrated the importance of hydrophobic balance in proper PLN regulation of SERCA. We found that Arg(9) → Leu and Thr(8) → Cys substitutions mimicked the behavior of the R9C mutant, and an Arg(14) → Ala substitution mimicked the behavior of the R14del mutant. The results reveal that the change in hydrophobicity resulting from the R9C and R14del mutations is sufficient to explain the loss of function and persistent interaction with SERCA. Hydrophobic imbalance in the cytoplasmic domain of PLN appears to be a predictor for the development and progression of dilated cardiomyopathy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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