Episomal and integrated human papillomavirus type 16 loads and anal intraepithelial neoplasia in HIV-seropositive men
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To assess levels of episomal and integrated human papillomavirus type 16 (HPV-16) loads in HIV-seropositive men who have sex with men (MSM) in anal infection and to study the association between episomal and integrated HPV-16 loads and anal intraepithelial neoplasia (AIN). STUDY DESIGN: A cohort study of 247 HIV-positive MSM followed each 6 months for 3 years. Overall, 135 (54.7%) men provided 665 HPV-16-positive anal samples. METHODS: Episomal and integrated HPV-16 loads were measured with quantitative real-time PCR assays. HPV-16 integration was confirmed in samples with a HPV-16 E6/E2 of 1.5 or more with PCR sequencing to demonstrate the presence of viral-cellular junctions. RESULTS: The HPV-16 DNA forms in anal samples were characterized as episomal only in 627 samples (94.3%), mixed in 22 samples (3.3%) and integrated only in nine samples (1.4%). HPV-16 episomal load [odds ratio (OR) = 1.5, 95% confidence interval (CI) 1.1-2.1], number of HPV types (OR = 1.4, 95% CI 1.1-1.8) and current smoking (OR = 4.8, 95% CI 1.3-18.6) were associated with high-grade AIN (AIN-2,3) after adjusting for age and CD4 cell counts. Integrated HPV-16 load was not associated with AIN-2,3 (OR = 0.7, 95% CI 0.4-1.1). Considering men with AIN-1 at baseline, four (16.7%) of the 24 men who progressed to AIN-2,3 had at least one sample with integrated HPV-16 DNA compared with three (23.1%) of 13 men who did not progress (OR = 0.7, 95% CI 0.2-3.8; P = 0.64). Integration was detected in similar proportions in samples from men without AIN, with AIN-1 or AIN-2,3. CONCLUSION: High episomal HPV-16 load but not HPV-16 integration load measured by real-time PCR was associated with AIN-2,3.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».