Distribution and abundance of uncultured heterotrophic flagellates in the world oceans
Notice bibliographique
Résumé
Heterotrophic flagellates play fundamental roles in marine ecosystems as picoplankton grazers. This recognized importance contrasts with our ignorance of the taxonomic composition of this functional group, which remains mostly unidentified by microscopical and culturing approaches. Recent molecular marine surveys based on 18S rDNA genes have retrieved many sequences unrelated to cultured organisms and marine stramenopiles were among the first reported uncultured eukaryotes. However, little is known about the organisms corresponding to these sequences. Here we determine the abundance of several marine stramenopile lineages in surface marine waters using molecular probes and fluorescent in situ hybridization. We show that these protists are free-living bacterivorous heterotrophic flagellates. They were widely distributed, occurring in the five world oceans, and accounted for a significant fraction (up to 35%) of heterotrophic flagellates in diverse geographic regions. A single group, MAST-4, represented 9% of cells within this functional assemblage, with the intriguing exception of polar waters where it was absent. MAST-4 cells likely contribute substantially to picoplankton grazing and nutrient re-mineralization in vast areas of the oceans and represent a key eukaryotic group in marine food webs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».