Matrix protein mediated shutdown of host cell metabolism limits vesicular stomatitis virus-induced interferon-alpha responses to plasmacytoid dendritic cells
Notice bibliographique
Résumé
Upon infection with many different viruses, plasmacytoid dendritic cells (pDC) produce large amounts of type I interferon (IFN-alpha/beta). To address why upon vesicular stomatitis virus (VSV) infection pDC, but not conventional myeloid DC (mDC), are induced to produce IFN-alpha, pDC and mDC were differentiated from bone marrow cells (BM-DC). Upon VSV infection BM-pDC produced IFN-alpha, whereas BM-mDC did not. Notably, upon infection with VSV-M2, a VSV variant expressing a M51R mutant matrix (M) protein that showed a reduced sequestration of host cell metabolism, BM-pDC and BM-mDC mounted massive IFN-alpha responses. Both DC subsets showed comparable RNA levels of retinoic acid inducible gene-I (RIG-I) and Toll-like receptor (TLR) 7 and were able to respond upon triggering with double-stranded RNA (dsRNA) or single-stranded RNA (ssRNA) analogs. Moreover, upon VSV-M2 infection IFN-alpha production by both DC subsets was largely dependent on viral replication. Interestingly, upon virus infection BM-pDC, but not BM-mDC, up-regulated mRNA levels of nuclear export factors Nup96/98, probably reflecting cellular mechanisms to circumvent viral escape strategies. Collectively, these results indicated that cell types induced to produce IFN-alpha upon viral infection are not primarily defined by cellular receptor configurations but rather by complex virus/host cell interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».