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Enregistrement W2027472801 · doi:10.1074/jbc.275.8.5997

Expression of Distinct ERG Proteins in Rat, Mouse, and Human Heart

2000· article· en· W2027472801 sur OpenAlexaff
Amber Pond, Bridget K. Scheve, Andrew T. Benedict, Kevin Petrecca, David R. Van Wagoner, Alvin Shrier, Jeanne M. Nerbonne

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular biologyMolecular massBlotBiologyProtein subunitAlternative splicingHeterologousGeneMessenger RNABiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One form of inherited long QT syndrome, LQT2, results from mutations in HERG1, the human ether-a-go-go-related gene, which encodes a voltage-gated K(+) channel alpha subunit. Heterologous expression of HERG1 gives rise to K(+) currents that are similar (but not identical) to the rapid component of delayed rectification, I(Kr), in cardiac myocytes. In addition, N-terminal splice variants of HERG1 and MERG1 (mouse ERG1) referred to as HERG1b and MERG1b have been cloned and suggested to play roles in the generation of functional I(Kr) channels. In the experiments here, antibodies generated against HERG1 were used to examine ERG1 protein expression in heart and in brain. In Western blots of extracts of QT-6 cells expressing HERG1, MERG1, or RERG1 (rat ERG1) probed with antibodies targeted against the C terminus of HERG1, a single 155-kDa protein is identified, whereas a 95-kDa band is evident in blots of extracts from cells expressing MERG1b or HERG1b. In immunoblots of fractionated rat (and mouse) brain and heart membrane proteins, however, two prominent high molecular mass proteins of 165 and 205 kDa were detected. Following treatment with glycopeptidase F, the 165- and 205-kDa proteins were replaced by two new bands at 175 and 130 kDa, suggesting that ERG1 is differentially glycosylated in rat/mouse brain and heart. In human heart, a single HERG1 protein with an apparent molecular mass of 145 kDa is evident. In rats, ERG1 protein (and I(Kr)) expression is higher in atria than ventricles, whereas in humans, HERG1 expression is higher in ventricular, than atrial, tissue. Taken together, these results suggest that the N-terminal alternatively spliced variants of ERG1 (i.e. ERG1b) are not expressed at the protein level in rat, mouse, or human heart and that these variants do not, therefore, play roles in the generation of functional cardiac I(Kr) channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,421

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations165
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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