Transcriptional regulation of histidine biosynthesis genes in <i>Corynebacterium glutamicum</i>
Notice bibliographique
Résumé
Corynebacterium glutamicum, a gram-positive bacterium, has been widely used for industrial amino acid production. Corynebacterium glutamicum his genes are located and transcribed in two unlinked loci, hisEG and hisDCB-orf1-orf2-hisHA-impA-hisFI. The latter his operon starts the transcription at the C residue localized 196 bp upstream of the hisD ATG start codon. Our computer-based sequence analysis showed that the region corresponding to the untranslated 5' end of the transcript, named the hisD leader region, displays the typical features of the T-box transcriptional attenuation mechanism. Therefore, expression of the cat reporter gene under the control of the wild-type or mutated hisD leader regions was tested in multi-copy (pProm and pTer series) and in single-copy (pInt series) systems under conditions of sufficient or limited histidine. Our mutational studies led to the conclusion that the CAU histidine specifier and 5'-UGGA-3' sequence in the hisD leader region are required for the hisDCB-orf1-orf2-hisHA-impA-hisFI gene regulation. The cat gene expression from the wild-type leader region was negatively regulated by histidine. However, the cat gene expression from mutated leader regions was irresponsive to the level of histidine in the growth medium. Taken together, we propose that a T-box mediated attenuation mechanism is responsible for the gene expression of the hisDCB-orf1-orf2-hisHA-impA-hisFI operon in C. glutamicum.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».