Sequence variation in four mitochondrial genes of the salmon louse Lepeophtheirus salmonis
Notice bibliographique
Résumé
A total of 210 Lepeophtheirus salmonis collected from 7 locations (Scotland, Russia, Canada, Japan and 3 locations in Norway), were screened for sequence variation in 4 mitochondrial genes; ATPase subunit 6 (A6), Cytochrome b oxidase subunit I (COI), Cytochrome b (Cyt b) and 16S rRNA. A high level of intraspecific variation was observed within all genes. The majority of polymorphisms were present in single individuals only, which resulted in a high number of private haplotypes within each gene. Little evidence of genetic differentiation was observed among the 3 Norwegian locations or between L. salmonis samples from Norway, Scotland and Russia. Pairwise FST values indicated that a weak degree of sub-division between L. salmonis sampled in Canada and the Northeast Atlantic might, however, exist. All samples collected in the Atlantic were highly different from the Japanese sample. It is suggested that the lack of genetic differentiation among lice samples from the North Atlantic is a result of extensive gene flow mediated by passive transport of L. salmonis larvae, and the migratory pattern of its salmonid hosts.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».