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Enregistrement W2027681787 · doi:10.1016/j.cub.2014.05.069

Cellular Control of Cortical Actin Nucleation

2014· article· en· W2027681787 sur OpenAlexaff
Miia Bovellan, Yves Roméo, Maté Biro, Annett Boden, Priyamvada Chugh, Amina Yonis, Malti Vaghela, Marco Fritzsche, Dale Moulding, Richard Thorogate, Antoine Jégou, Adrian J. Thrasher, Guillaume Romet‐Lemonne, Philippe P. Roux, Ewa K. Paluch, Guillaume Charras

Notice bibliographique

RevueCurrent Biology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular Mechanics and Interactions
Établissements canadiensUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and Cancer
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésBiologyNucleationActinCell biologyNeuroscienceComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The contractile actin cortex is a thin layer of actin, myosin, and actin-binding proteins that subtends the membrane of animal cells. The cortex is the main determinant of cell shape and plays a fundamental role in cell division [1-3], migration [4], and tissue morphogenesis [5]. For example, cortex contractility plays a crucial role in amoeboid migration of metastatic cells [6] and during division, where its misregulation can lead to aneuploidy [7]. Despite its importance, our knowledge of the cortex is poor, and even the proteins nucleating it remain unknown, though a number of candidates have been proposed based on indirect evidence [8-15]. Here, we used two independent approaches to identify cortical actin nucleators: a proteomic analysis using cortex-rich isolated blebs, and a localization/small hairpin RNA (shRNA) screen searching for phenotypes with a weakened cortex or altered contractility. This unbiased study revealed that two proteins generated the majority of cortical actin: the formin mDia1 and the Arp2/3 complex. Each nucleator contributed a similar amount of F-actin to the cortex but had very different accumulation kinetics. Electron microscopy examination revealed that each nucleator affected cortical network architecture differently. mDia1 depletion led to failure in division, but Arp2/3 depletion did not. Interestingly, despite not affecting division on its own, Arp2/3 inhibition potentiated the effect of mDia1 depletion. Our findings indicate that the bulk of the actin cortex is nucleated by mDia1 and Arp2/3 and suggest a mechanism for rapid fine-tuning of cortex structure and mechanics by adjusting the relative contribution of each nucleator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations253
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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