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Enregistrement W2027732582 · doi:10.4056/sigs.4187859

The Hospital Microbiome Project: Meeting report for the 2nd Hospital Microbiome Project, Chicago, USA, January 15th, 2013

2013· article· en· W2027732582 sur OpenAlexaff
Benjamin D. Shogan, Daniel P. Smith, Aaron I. Packman, Scott T. Kelley, Emily Landon, Seema Bhangar, Gary J. Vora, Rachael M. Jones, Kevin Keegan, Brent Stephens, Tiffanie Ramos, Benjamin C Kirkup, Hal Levin, Mariana Rosenthal, Betsy Foxman, Eugene B. Chang, Jeffrey A. Siegel, Sarah Cobey, Gary An, John C. Alverdy, Paula Olsiewski, Mark O. Martin, Rachel Marrs, Mark Hernandez, Scott Christley, Michael J. Morowitz, Stephen G. Weber, Jack A. Gilbert

Notice bibliographique

RevueStandards in Genomic Sciences · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesUniversity of ChicagoAlfred P. Sloan Foundation
Mots-clésMicrobiomeHuman Microbiome ProjectMedicineBiologyBioinformaticsHuman microbiome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This report details the outcome of the 2nd Hospital Microbiome Project workshop held on January 15 th at the University of Chicago, USA.This workshop was the final planning meeting prior to the start of the Hospital Microbiome Project, an investigation to measure and characterize the development of a microbial community within a newly built hospital at the University of Chicago.The main goals of this workshop were to bring together experts in various disciplines to discuss the potential hurdles facing the implementation of the project, and to allow brainstorming of potential synergistic project opportunities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,024
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,011
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,039
Score d'incertitude au seuil0,131

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0240,011
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0050,002
Science ouverte0,0020,006
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0390,022

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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