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Enregistrement W2027817494 · doi:10.4141/p04-006

Construction and characterization of chromosome 1B specific DNA library of wheat

2005· article· en· W2027817494 sur OpenAlexvenueno aff
Fayun Zhang, Wei-Bo Yin, Rui Shi, Yingkao Hu, Yueming Yan, Yuhong Chen, Yihua Zhou, Jun Hu, Richard R.‐C. Wang, Zanmin Hu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyChromosomeGeneticsMolecular biologyGenomic libraryChromosome 22genomic DNABacterial artificial chromosomeChromosome 21Polymerase chain reactionDNAGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chromosome 1B was microdissected and collected from chromosome spreads of wheat (Triticum aestivum L. ‘Jing 411’), using a glass needle. DNA of the isolated chromosome was amplified in vitro by Sau3A linker adaptor-mediated polymerase chain reaction (LA-PCR). The second-round PCR products were verified by Southern hybridization using DIG-labeled genomic DNA of wheat. The results initially showed the DNA was from wheat genome. A pair of SSR primers specific to chromosome 1B was used to verify the origin of the PCR products from the isolated chromosome. The results confirmed that the PCR products originated from chromosome 1B. The second round of PCR products from chromosome 1B were cloned into plasmid pUCm-T vectors to create a chromosome-specific library, which included approximately 248 000 recombinant clones. Characterization of 100 randomly selected clones of the library showed that the insert size ranged between 0.5 and 2.0 kb, with an average of 1 kb. Randomly selected 288 clones were characterized with dot blot hybridization, of which 57.2% were medium/high copy clones and 42.8% low/single copy clones. The application of this technique to establish high-density molecular maps for chromosome 1B is discussed. Key words: Wheat, chromosome microdissection, chromosome-specific library

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,162
Écart entre enseignants0,153 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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