Construction and characterization of chromosome 1B specific DNA library of wheat
Notice bibliographique
Résumé
Chromosome 1B was microdissected and collected from chromosome spreads of wheat (Triticum aestivum L. ‘Jing 411’), using a glass needle. DNA of the isolated chromosome was amplified in vitro by Sau3A linker adaptor-mediated polymerase chain reaction (LA-PCR). The second-round PCR products were verified by Southern hybridization using DIG-labeled genomic DNA of wheat. The results initially showed the DNA was from wheat genome. A pair of SSR primers specific to chromosome 1B was used to verify the origin of the PCR products from the isolated chromosome. The results confirmed that the PCR products originated from chromosome 1B. The second round of PCR products from chromosome 1B were cloned into plasmid pUCm-T vectors to create a chromosome-specific library, which included approximately 248 000 recombinant clones. Characterization of 100 randomly selected clones of the library showed that the insert size ranged between 0.5 and 2.0 kb, with an average of 1 kb. Randomly selected 288 clones were characterized with dot blot hybridization, of which 57.2% were medium/high copy clones and 42.8% low/single copy clones. The application of this technique to establish high-density molecular maps for chromosome 1B is discussed. Key words: Wheat, chromosome microdissection, chromosome-specific library
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».