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Enregistrement W2027829556 · doi:10.1038/ncomms6614

Mutations in PNPLA6 are linked to photoreceptor degeneration and various forms of childhood blindness

2015· article· en· W2027829556 sur OpenAlexafffund
Stanislav Kmoch, Jacek Majewski, Vasanth Ramamurthy, Shenghao Cao, Somayyeh Fahiminiya, Haitao Ren, Ian M. MacDonald, I. López, Vincent Sun, Vafa Keser, Ayesha Khan, Viktor Stránecký, Hana Hartmannová, Anna Přistoupilová, Kateřina Hodaňová, Lenka Piherová, Ladislav Kuchař, A Baxová, R Chen, Orlando Graziani Póvoas Barsottini, Angela Pyle, Helen Griffin, Miranda Splitt, Juliana Maria Ferraz Sallum, John Tolmie, Julian R. Sampson, Patrick F. Chinnery, Kym M. Boycott, Alex MacKenzie, Michael Brudno, Dennis E. Bulman, David A. Dyment, Eyal Banin, Dror Sharon, Sayantanee Dutta, Rudi Grebler, C. Helfrich-Foerster, José Luiz Pedroso, Doris Kretzschmar, Michel Cayouette, R. K. Koenekoop

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVenomous Animal Envenomation and Studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity of OttawaRoyal Alexandra HospitalUniversité de MontréalUniversity of AlbertaChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill UniversityMcGill University Health CentreMontreal Clinical Research InstituteMontreal Children's HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Eye InstituteEuropean Regional Development FundMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoOntario Genomics InstituteGenome British ColumbiaGovernment of CanadaWellcome TrustNational Institutes of HealthFoundation Fighting BlindnessOntario GenomicsGenome CanadaUniversity of OttawaMcGill UniversityMinisterstvo Zdravotnictví Ceské RepublikyUniverzita Karlova v Praze
Mots-clésRetinal degenerationHereditary spastic paraplegiaBiologyPhotoreceptor cellRetinitis pigmentosaDegeneration (medical)MutationCell biologyGeneticsRetinaNeuroscienceMedicinePathologyGenePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blindness due to retinal degeneration affects millions of people worldwide, but many disease-causing mutations remain unknown. PNPLA6 encodes the patatin-like phospholipase domain containing protein 6, also known as neuropathy target esterase (NTE), which is the target of toxic organophosphates that induce human paralysis due to severe axonopathy of large neurons. Mutations in PNPLA6 also cause human spastic paraplegia characterized by motor neuron degeneration. Here we identify PNPLA6 mutations in childhood blindness in seven families with retinal degeneration, including Leber congenital amaurosis and Oliver McFarlane syndrome. PNPLA6 localizes mostly at the inner segment plasma membrane in photoreceptors and mutations in Drosophila PNPLA6 lead to photoreceptor cell death. We also report that lysophosphatidylcholine and lysophosphatidic acid levels are elevated in mutant Drosophila. These findings show a role for PNPLA6 in photoreceptor survival and identify phospholipid metabolism as a potential therapeutic target for some forms of blindness. Blindness due to retinal degeneration affects millions of people worldwide, but many disease-causing mutations remain unknown. Here the authors link mutations in the gene PNPLA6 with childhood blindness in seven families with retinal degeneration and show that the gene plays a role in photoreceptor survival in Drosophila.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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