Molecular characterization of a 2.7-kb, 12q13-specific, retroviral-related sequence isolated by RDA from monozygotic twin pairs discordant for schizophrenia
Notice bibliographique
Résumé
This report deals with the molecular characterization of a representational difference analysis (RDA)-derived sequence (SZRV-2, GenBank accession No. AF135486; Genome Database accession Nos. 7692183 and 7501402) from three monozygotic twin pairs discordant for schizophrenia (MZD). The results suggest that it is a primate-specific, heavily methylated, and placentally expressed (-7-kb mRNA) endogenous retroviral-related (ERV) sequence of the human genome. We have mapped this sequence to 12q13 using two SZRV-2 positive BAC clones (4K11 (Genome Survey Sequence Database No. 1752076; GenBank accession No. AZ301773) and 501H16) by fluorescence in situ hybridization. End sequencing of the 4K11 BAC clone has allowed identification of nearby genes from the human genome database at NCBI that may be of interest in schizophrenia research. These include viral-related sequences (potential hot spots for insertions), developmental, channel, and signal transduction genes, as well as genes affecting expression of certain receptors in neurons. Furthermore, when used as a probe on Southern blots, SZRV-2 detected no difference between schizophrenia patients from southwestern Ontario and their matched controls. However, it identified aberrant methylation in one of the eight patients and none of the 21 unaffected controls. Although additional experiments will be required to establish the significance, if any, of SZRV-2 methylation in the complex etiology of schizophrenia, molecular results included offer a novel insight into the role of retroviral-related sequences in the origin, organization, and regulation of the human genome.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».