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Enregistrement W2027896953 · doi:10.1021/jp905915m

Mitochondrial Membranes with Mono- and Divalent Salt: Changes Induced by Salt Ions on Structure and Dynamics

2009· article· en· W2027896953 sur OpenAlexafffund
Sanja Pöyry, Tomasz Róg, Mikko Karttunen, Ilpo Vattulainen

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDivalentChemistrySalt (chemistry)IonMembraneDiffusionBiophysicsCrystallographyMolecular dynamicsRotational diffusionConformational changeInorganic chemistryBiochemistryMoleculeComputational chemistryOrganic chemistryThermodynamics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We employ atomistic simulations to consider how mono- (NaCl) and divalent (CaCl(2)) salt affects properties of inner and outer membranes of mitochondria. We find that the influence of salt on structural properties is rather minute, only weakly affecting lipid packing, conformational ordering, and membrane electrostatic potential. The changes induced by salt are more prominent in dynamical properties related to ion binding and formation of ion-lipid complexes and lipid aggregates, as rotational diffusion of lipids is slowed down by ions, especially in the case of CaCl(2). In the same spirit, lateral diffusion of lipids is slowed down rather considerably for increasing concentration of CaCl(2). Both findings for dynamic properties can be traced to the binding of ions with lipid head groups and the related changes in interaction patterns in the headgroup region, where the binding of Na(+) and Ca(2+) ions is clearly different. The role of cardiolipins in these phenomena turns out to be important.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,412

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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