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Enregistrement W2027926038 · doi:10.1159/000343742

Matrix Metalloproteinase-9 Gene Polymorphisms and Chronic Kidney Disease

2012· article· en· W2027926038 sur OpenAlexaff
Rieko Okada, Sayo Kawai, Mariko Naito, Asahi Hishida, Nobuyuki Hamajima, Koichi Shinchi, Tanvir Chowdhury Turin, Sadao Suzuki, Eva Mariane Mantjoro, Kengo Toyomura, Kokichi Arisawa, Nagato Kuriyama, Satoyo Hosono, Haruo Mikami, Michiaki Kubo, Hideo Tanaka, Kenji Wakai

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Nephrology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of Science
Mots-clésKidney diseaseHaplotypeMedicineGenotypeOdds ratioInternal medicineRenal functionMatrix metalloproteinaseMMP9PopulationSingle-nucleotide polymorphismAlleleGastroenterologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The aim of this study was to explore the associations between the prevalence of chronic kidney disease (CKD) and polymorphisms in the genes encoding matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitor of matrix metalloproteinases (TIMPs). MMPs degrade extracellular matrix proteins in the glomerulus, and play important roles in kidney disease progression. METHODS: DNA samples from 3,309 subjects aged 35-69 years were genotyped for 10 potentially functional polymorphisms in MMP and TIMP genes. The prevalence of CKD (estimated glomerular filtration rate <60 ml/min/1.73 m(2)) was compared among the genotypes. RESULTS: The prevalence of CKD decreased significantly with the number of minor alleles in MMP9 C-1562T (odds ratios (ORs) 0.77 for CT and 0.65 for TT compared with CC; p for trend = 0.023) and MMP9 R668Q (ORs, 0.79 for RQ and 0.64 for QQ compared with RR; p for trend = 0.024). The haplotype MMP9 -1562T/279R/668Q showed a reduced risk for CKD compared with the most common -1562C/279R/668R (OR 0.77, p = 0.008), and the genotype combination -1562TT/ 279RR/668QQ showed a halved risk for CKD compared with major allele homozygous -1562CC/279RR/668RR (OR 0.53, p = 0.091). CONCLUSION: The potentially functional polymorphisms of MMP9 were associated with the prevalence of CKD in a large Japanese population. These genotypes have been reported to increase MMP9 expression, supporting the hypothesis that MMP-9 has a protective role in the progression of kidney diseases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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