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Enregistrement W2028005779 · doi:10.1371/journal.pone.0094251

Specificity of Anti-Tau Antibodies when Analyzing Mice Models of Alzheimer's Disease: Problems and Solutions

2014· article· en· W2028005779 sur OpenAlexafffund
Franck R. Petry, Jérôme Pelletier, Alexis Bretteville, Françoise Morin, Frédéric Calon, Sébastien S. Hébert, Robert A. Whittington, Emmanuel Planel

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversité Laval
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of California, IrvineNational Institute of General Medical SciencesAlzheimer Society
Mots-clésPolyclonal antibodiesAntibodyGenetically modified mouseHyperphosphorylationMonoclonal antibodyTau proteinMolecular biologyTransgenePrimary and secondary antibodiesWestern blotMonoclonalBiologyBlotAlzheimer's diseasePhosphorylationImmunologyMedicineCell biologyPathologyBiochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aggregates of hyperphosphorylated tau protein are found in a group of diseases called tauopathies, which includes Alzheimer's disease. The causes and consequences of tau hyperphosphorylation are routinely investigated in laboratory animals. Mice are the models of choice as they are easily amenable to transgenic technology; consequently, their tau phosphorylation levels are frequently monitored by Western blotting using a panel of monoclonal/polyclonal anti-tau antibodies. Given that mouse secondary antibodies can recognize endogenous mouse immunoglobulins (Igs) and the possible lack of specificity with some polyclonal antibodies, non-specific signals are commonly observed. Here, we characterized the profiles of commonly used anti-tau antibodies in four different mouse models: non-transgenic mice, tau knock-out (TKO) mice, 3xTg-AD mice, and hypothermic mice, the latter a positive control for tau hyperphosphorylation. We identified 3 tau monoclonal antibody categories: type 1, characterized by high non-specificity (AT8, AT180, MC1, MC6, TG-3), type 2, demonstrating low non-specificity (AT270, CP13, CP27, Tau12, TG5), and type 3, with no non-specific signal (DA9, PHF-1, Tau1, Tau46). For polyclonal anti-tau antibodies, some displayed non-specificity (pS262, pS409) while others did not (pS199, pT205, pS396, pS404, pS422, A0024). With monoclonal antibodies, most of the interfering signal was due to endogenous Igs and could be eliminated by different techniques: i) using secondary antibodies designed to bind only non-denatured Igs, ii) preparation of a heat-stable fraction, iii) clearing Igs from the homogenates, and iv) using secondary antibodies that only bind the light chain of Igs. All of these techniques removed the non-specific signal; however, the first and the last methods were easier and more reliable. Overall, our study demonstrates a high risk of artefactual signal when performing Western blotting with routinely used anti-tau antibodies, and proposes several solutions to avoid non-specific results. We strongly recommend the use of negative (i.e., TKO) and positive (i.e., hypothermic) controls in all experiments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations147
Publié2014
Routes d'admission2
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