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Enregistrement W2028025451 · doi:10.1002/jmr.938

The Max homodimeric b‐HLH‐LZ significantly interferes with the specific heterodimerization between the c‐Myc and Max b‐HLH‐LZ in absence of DNA: a quantitative analysis

2009· article· en· W2028025451 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Recognition · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésTranscription factorPopulationTranscription (linguistics)CarcinogenesisBiologyCell biologyGeneChemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Specific heterodimerization plays a crucial role in the regulation of the biology of the cell. For example, the specific heterodimerization between the b-HLH-LZ transcription factors c-Myc and Max is a prerequisite for c-Myc transcriptional activity that leads to cell growth, proliferation and tumorigenesis. On the other hand, the Mad proteins can compete with c-Myc for Max. The Mad/Max heterodimer antagonizes the effect of the c-Myc/Max heterodimer. In this contribution, we have focused on the specific heterodimerization between the b-HLH-LZ domains of c-Myc and Max using CD and NMR. While the c-Myc and Max b-HLH-LZ domains are found to preferentially form a heterodimer; we demonstrate for the first time that a significant population of the Max homodimeric b-HLH-LZ can also form and hence interferes significantly with the specific heterodimerization. This indicates that the Max/Max homodimer can also interfere with c-Myc/Max functions, therefore adding to the complexity of the regulation of transcription by the Myc/Max/Mad network. The demonstration of the existence of the homodimeric population was made possible by the application of numerical routines that enable the simulation of composite spectroscopic signal (e.g. CD) as a function of temperature and total concentration of proteins. From a systems biology perspective, our routines may be of general interest as they offer the opportunity to treat many competing equilibriums in order to predict the probability of existence of protein complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,248
Score d'incertitude au seuil0,308

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle