Bpag1 localization to actin filaments and to the nucleus is regulated by its N-terminus
Notice bibliographique
Résumé
Plakins are a family of giant cytoskeleton binding proteins. One member of this group is bullous pemphigoid antigen 1 (Bpag1)/dystonin, which has neuronal and muscle isoforms that consist of actin-binding and microtubule-binding domains at either end separated by a plakin domain and several spectrin repeats. The better-characterized epithelial isoform has only the plakin domain in common with the neuronal and muscle isoforms. Here, we have analyzed the localization of muscle/neuronal (Bpag1a/b) isoforms and the epithelial (Bpag1e) isoform within C2C12 myoblast cells. Although an antibody specific to Bpag1a/b isoform 2 detected protein co-aligning actin stress fibers, this same antibody and two Bpag1e antibodies predominantly detected protein in the nuclei. A Bpag1a/b isoform 2 N-terminal fusion protein containing the plakin domain also localized to actin stress fibers and to nuclei. Within the plakin domain, we characterized a functional nuclear localization signal, which was responsible for localization of the fusion protein to the nucleus. Bpag1a/b isoform 1 N-terminal fusion proteins differed in their interaction with the actin cytoskeleton and with their ability to localize to the nucleus, suggesting that Bpag1 isoforms with different N-termini have differing roles. These results show the importance of N-terminal domains in dictating the localization and function of Bpag1 isoforms. We provide the first indication that Bpag1 is not strictly a cytoplasmic/membrane protein but that it can also localize to the nucleus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».