MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2028169159 · doi:10.1074/jbc.m112.445890

MicroRNA-34c Inversely Couples the Biological Functions of the Runt-related Transcription Factor RUNX2 and the Tumor Suppressor p53 in Osteosarcoma

2013· article· en· W2028169159 sur OpenAlexaff
Margaretha van der Deen, Hanna Taipaleenmäki, Ying Zhang, Nadiya M. Teplyuk, Anurag Gupta, Senthilkumar Cinghu, Kristen L. Shogren, Avudaiappan Maran, Michael J. Yaszemski, Ling Ling, Simon M. Cool, David Tai Leong, Christian Dierkes, Jozef Zustin, Manuel Salto‐Tellez, Yoshiaki Ito, Suk‐Chul Bae, Maria Zieleńska, Jeremy A. Squire, Jane B. Lian, Janet L. Stein, Gerard P. Zambetti, Stephen N. Jones, Mario Galindo, Eric Hesse, Gary S. Stein, André J. van Wijnen

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensKingston General HospitalQueen's UniversityHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Cancer Institute
Mots-clésOsteosarcomaRUNX2SuppressorTranscription factorCancer researchmicroRNABiologyTranscription (linguistics)Cell biologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Osteosarcoma (OS) is a primary bone tumor that is most prevalent during adolescence. RUNX2, which stimulates differentiation and suppresses proliferation of osteoblasts, is deregulated in OS. Here, we define pathological roles of RUNX2 in the etiology of OS and mechanisms by which RUNX2 expression is stimulated. RUNX2 is often highly expressed in human OS biopsies and cell lines. Small interference RNA-mediated depletion of RUNX2 inhibits growth of U2OS OS cells. RUNX2 levels are inversely linked to loss of p53 (which predisposes to OS) in distinct OS cell lines and osteoblasts. RUNX2 protein levels decrease upon stabilization of p53 with the MDM2 inhibitor Nutlin-3. Elevated RUNX2 protein expression is post-transcriptionally regulated and directly linked to diminished expression of several validated RUNX2 targeting microRNAs in human OS cells compared with mesenchymal progenitor cells. The p53-dependent miR-34c is the most significantly down-regulated RUNX2 targeting microRNAs in OS. Exogenous supplementation of miR-34c markedly decreases RUNX2 protein levels, whereas 3′-UTR reporter assays establish RUNX2 as a direct target of miR-34c in OS cells. Importantly, Nutlin-3-mediated stabilization of p53 increases expression of miR-34c and decreases RUNX2. Thus, a novel p53-miR-34c-RUNX2 network controls cell growth of osseous cells and is compromised in OS. Background: Osteosarcoma (OS) is associated with loss of tumor suppressor p53 and increased Runx2. Results: Runx2 and p53 levels are inversely correlated in OS. miR-34c, which targets Runx2, is absent in OS and elevated by p53. Conclusion: p53, miR-34c, and Runx2 form a regulatory loop that is compromised in OS. Significance: RUNX2 could be targeted by miR-34c to prevent OS growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,198 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetMicroRNA in disease regulationTravaux en français237 207