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Enregistrement W2028203622 · doi:10.1097/mph.0b013e3181772141

Rare Occurrence of PHOX2b Mutations in Sporadic Neuroblastomas

2008· article· en· W2028203622 sur OpenAlexaff
Alexandre Serra, Beate Häberle, Inke R. König, Roland Kappler, Meinolf Suttorp, Hans K. Schackert, D. Roesner, Guido Fitze

Notice bibliographique

RevueJournal of Pediatric Hematology/Oncology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonMissense mutationNeural crestGeneticsGeneNeuroblastomaMutationBiologyCandidate geneCancer researchMedicineBioinformaticsCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuroblastomas (NBs) are frequent solid tumors in childhood for which no specific genetic marker linked to their development has been identified to date. PHOX2b, which regulates the autonomic neuron development, has been associated with the development of autonomic diseases, and has been considered a potential candidate gene for neural crest-derived tumors such as NB. To ascertain the role of the PHOX2b gene in NB development, we have sequenced the complete PHOX2b coding region in tumors from 69 patients with sporadic NB, while 130 blood donors served as negative controls and 9 NB cell lines as positive controls. We found a missense deletion in exon 3 in a cell line. A further silent mutation in exon 3 (c.870C>A) was observed in 3 tumors but in none of the controls. A new polymorphism in intron 1 (IVS1-114 G>A) was observed in 31 tumor samples (44.9%) and in 68 controls (52.3%). We did not find any conclusive association of the polymorphisms or mutations in PHOX2b with the development of NB, although the large confidence intervals neither substantiate nor exclude a role for this gene in the tumor etiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,285
Score d'incertitude au seuil0,570

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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