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Enregistrement W2028243516 · doi:10.1097/ico.0b013e318226155f

Role of the TCF4 Gene Intronic Variant in Normal Variation of Corneal Endothelium

2011· article· en· W2028243516 sur OpenAlexfundno aff
David A. Mackey, Nicole M. Warrington, Alex W. Hewitt, Sandra K. Oates, Seyhan Yazar, Alla Soloshenko, Geoffrey J. Crawford, Jenny A. Mountain, Craig E. Pennell

Notice bibliographique

RevueCornea · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCorneal surgery and disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGenotypeAlleleCorneal endotheliumOphthalmologyCoefficient of variationMedicineAndrologyBiologyGeneticsPathologyInternal medicineCorneaGeneChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To identify early features of Fuchs endothelial dystrophy (FED) in carriers of the rs613872(G) transcription factor 4 gene (TCF4) aged 20 to 21 years. METHODS: Prospective cohort study of people aged 20 to 21 years previously enrolled in the Western Australia Pregnancy (Raine) Cohort. Specular microscopy was performed using a noncontact specular microscopy (EM-3000; Tomey, Nagoya, Japan). Individual genotype data were extracted from the genome-wide Illumina 660 Quad Array. Analysis of the association between the rs613872 risk allele in TCF4 and specular microscopic measurements was conducted. RESULTS: Association between the rs613872 risk allele and corneal endothelial cell density (CD) as well as the coefficient of variation in cell shape was the main outcome measure. Genotype and specular microscopic data were available for a total of 445 participants (46% women). The median CD was 2851 and 2850 cells per square millimeter in the right and left eyes, respectively. No significant differences between intereye variability in endothelial CD were seen (right eye to left eye correlation = 0.64); however, a significant difference in variability of endothelial CD between men and women was observed (male: OD, 2839 ± 124 cells/mm² and OS, 2845 ± 124 cells/mm² vs. female: OD, 2838 ± 134 cells/mm² and OS, 2842 ± 132 cells/mm²; OD, P = 0.0013 and OS, P = 0.0016). Eleven individuals were homozygous for the rs613872 risk allele. We found no association between rs613872 genotype and CD or coefficient of variation. One of 11 homozygous GG individuals was found to have a gutta in 1 sample field on specular microscopy, whereas 2 of 297 TT individuals also had a gutta each in 1 sample field. CONCLUSIONS: We were unable to detect an association between TCF4 rs613872 genotype and the variation in corneal endothelial CD or variation in cell morphology in a healthy young adult population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,292
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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