Prevalence of shiga-toxigenic Escherichia coli O157:H7 in adult dairy cattle
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To describe shiga-toxigenic Escherichia coil O157:H7 (STEC O157:H7) fecal shedding prevalence, seasonal fecal shedding patterns, and site-specific prevalence from the oral cavity, skin, and feces of dairy cattle. DESIGN: Cross-sectional study. ANIMALS: Adult dairy cattle from 13 herds in Louisiana. PROCEDURE: Samples were cultured for STEC O157 by use of sensitive and specific techniques, including selective broth enrichment, immunomagnetic separation, monoclonal antibody-based O:H enzyme immunoassay serotyping, and polymerase chain reaction virulence gene characterization. Point estimates and 95% confidence intervals were calculated for fecal shedding prevalence as well as site-specific prevalence from the oral cavity, skin, and feces. Logistic regression was used to assess seasonal variation and differences at various stages of lactation with respect to fecal shedding of STEC O157 in cattle sampled longitudinally. RESULTS: Summer prevalence in herds in = 13) was 38.5%, with a cow-level prevalence of 6.5%. Among positive herds, prevalence ranged from 3% to 34.6%. Samples from 3 of 5 herds sampled quarterly over 1 year yielded positive results for STEC O157. In herds with STEC O157, an increase in cow-level prevalence was detected during spring (13.3%) and summer (10.5%), compared with values for fall and winter. Site-specific prevalences of STEC O157:H7 from oral cavity, skin, and fecal samples were 0%, 0.7%, and 25.2%, respectively. CONCLUSIONS AND CLINICAL RELEVANCE: Our data indicated that STEC O157:H7 was commonly isolated from dairy cows in Louisiana, seasonally shed, and isolated from the skin surface but not the oral cavity of cows.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».