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Enregistrement W2028400695 · doi:10.1111/j.1398-9995.2008.01889.x

Polymorphisms in interleukin‐1 receptor‐associated kinase 4 are associated with total serum IgE

2009· article· en· W2028400695 sur OpenAlexaff
Marc A. Tewfik, Yohan Bossé, Mathieu Lemire, Thomas J. Hudson, Sophie Vallee‐Smejda, Hasan Al-Shemari, Catherine Laprise, Martin Desrosiers

Notice bibliographique

RevueAllergy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAsthma and respiratory diseases
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiHôtel-Dieu de MontréalUniversité de MontréalUniversité LavalOntario Institute for Cancer ResearchInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMontreal General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismImmunoglobulin EImmunologyPopulationAsthmaAlleleMedicineGenotypeBiologyGeneAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Serum immunoglobulin E (IgE) level is recognized to be under strong genetic control, but the causal and susceptibility genes remain to be identified. We sought to investigate the association between single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the Toll-like receptor (TLR) signaling pathway and total serum IgE level. METHODS: A population of 206 patients with severe chronic rhinosinusitis (CRS) was used. Precise phenotyping of patients was accomplished by means of a questionnaire and clinical examination. Blood was drawn for measurement of total serum IgE, as well as DNA extraction. A maximally informative set of SNPs in the TLR1, 2, 3, 4, 6, 9, 10, CD14, MD2, MyD88, IRAK4, and TRAF6 genes were selected and genotyped. Significant findings were replicated in a second independent population of 956 subjects from 227 families with asthma. RESULTS: A total of 97 out of 104 SNPs were successfully genotyped. Three SNPs in IRAK4--rs1461567, rs4251513, and rs4251559--were associated with total serum IgE levels (P < 0.004). In the replication sample, the same SNPs as well as the same orientation of the risk allele were associated with IgE levels (P < 0.031). CONCLUSIONS: These results demonstrate a clear association between polymorphisms in the IRAK4 gene and serum IgE levels in patients with CRS and asthma. IRAK4 may be important in the regulation of IgE levels in patients with inflammatory diseases of the airways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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